В 1932 году была образована Ашлыкская семилетняяшкола. В школе обучались дети и подростки из всех прилежащих деревень, включая деревни Межевую и Малюгину. А начальные классы учились в Шишкинской начальной школе. В 1977 году Ашлыкская восьмилетняя школа переехала во вновь отстроенное здание школы, которое было построено в с. Шишкино. И с 5 декабря 1977 года стала функционировать Шишкинская восьмилетняя школа. А в 1984 году школа была преобразована в среднюю. С 1977 по 2012 годы аттестат о среднем образовании получили 237 выпускников. За этот период школу закончили 373 учащихся.
Структура МАОУ Шишкинская СОШ
1. Структурное подразделение Шишкинский детский сад
2. Начальная школа
3. Средняя школа